微生物因其致病性对于人类健康和疾病预防十分重要。Amnis量化成像流式分析系统由于其具有图像参数,所以可以基于形态学对细菌进行分类,并且可以检测它们的复制过程。致病菌有一套跨越机体免疫系统的方法,其中包括对吞噬细胞内化作用的抑制。微生物与宿主细胞的相互作用是一个复杂的生物学过程,可以用Amnis量化成像流式分析系统研究这个过程,包括自身免疫系统对病原体的内吞和清除、胞内细菌的维持和扩增以及细菌感染对于宿主细胞信号通路和存活的影响。

示例:有害细菌鉴定和成丝化分析:

从培养或是残余食物当中获得的细菌可以定量的分析其大小、形态和特异性FISH探针的荧光强度。成丝化无论是复制缺陷造成的,还是对宿主免疫系统的反应,都可以测量。衡量细菌成丝程度使用的是尺寸参数——Length,测量的是选区(细胞)长度。第二幅图是用特异性FISH探针检测变质食物中的沙门氏菌。